Film bermula dari Scrat yang terjatuh dalam apa yang tampak seperti gua beku saat dirinya mencoba untuk mengubur biji eknya lagi.
Dia kemudian menemukan bahwa "gua" tersebut sebenarnya adalah piring terbang raksasa.
Tanpa sengaja Scrat membuat piring terbang aktif dan meluncur ke luar angkasa, hingga menyebabkan beberapa asteroid menuju ke Bumi selama proses tersebut.
Di Bumi, Manny dan Ellie sedang mempersiapkan pernikahan yang akan datang untuk putri mereka, Peaches dan tunangannya yang canggung dan baik hati, Julian.
Selama pesta HUT pernikahan Manny dan Ellie, asteroid menyerang tempat itu dan The Herd nyaris tidak bisa melarikan diri.
Sementara itu, di dunia bawah tanah yang hilang, Buck mengembalikan telur Triceratops kembali ke pemiliknya yang sah setelah dicuri oleh trio dromaeosaurus terbang bernama Gavin, Gertie, dan Roger.
Baca Juga: Sinopsis 'Sheriff: Narcotics & Integrity' yang Tayang di CGV!
Buck menemukan pilar batu kuno dan membawanya ke permukaan, tempat ia bertemu The Herd.
Buck menjelaskan kepada The Herd bahwa menurut pilar itu, asteroid telah menyebabkan dua kepunahan dari "benda-benda yang tampak seperti kepiting tapal kuda" dan dinosaurus di masa lalu.
Ia percaya bahwa satu-satunya tempat mereka dapat menemukan petunjuk untuk hentikan asteroid tersebut ada di situs dampak yang sebelumnya, karena menurut ukirannya, mereka selalu jatuh di tempat yang sama.
Namun, ketiga dromaeosaurus mendengar percakapan mereka, dan Gavin dan Gertie memutuskan untuk menghentikan mereka, percaya bahwa mereka dapat dengan mudah menghindari dampak.
Sehingga tidak hanya membalas dendam pada Buck, tetapi juga membunuh semua mamalia dan mengamankan dominasi atas Bumi untuk spesies mereka.
Lantas, bagaimana kisah petualangan The Herd dalam menghentikan laju astreoid agar tak menghancurkan Bumi?